С 1990 года по 1999 год
1990
Создан учебно-научный центр "Компьютерная оптика".
1990-97
Продолжаются работы в области оптического и оптико-электронного приборостроения (мультимодульный телескоп с апертурой, малогабаритные высокоточные лазерные высотомеры для космических аппаратов и т.д.); в области медицины и экологии (физиотерапевтический комплекс "Спектр", видеоспектрометр видимой и ИК-области спектра для мониторинга водных поверхностей и т.д.).
1991
В составе инженерно-физического факультета создана выпускающая кафедра компьютерные технологии, возглавляемая доктором технических наук, профессором Васильевым Владимиром Николаевичем (с 1996 года — ректор университета).
1991, Сентябрь
На базе института проведение Международной конференции по оптическому образованию "Education and Training in Optics" под эгидой Международного общества по оптической технике SPIE.
1991
Создание учебно-научно-производственного центра повышения квалификации преподавателей; создание гуманитарного факультета (декан — доцент Кириллов Александр Васильевич) с направлениями подготовки по менеджменту и экономике.
1992, Февраль
Переименование Ленинградского ордена Трудового Красного Знамени института точной механики и оптики в Санкт-Петербургский институт точной механики и оптики (постановление Государственного комитета РСФСР по делам науки и высшей школы от 11.02.1992 года №50 "О переименовании вузов города Санкт-Петербурга") (приказ от 14.02.1992 года №52-од).
1992, Сентябрь
Осуществлен набор первых студентов для обучения по образовательным программам бакалавриата.
1992-95
Организация на базе института ряда совместных предприятий, в т.ч. болгаро-российская фирма "Фотоника", немецко-российская фирма "Фокон".
1993
Создание естественнонаучного факультета с подготовкой по специальности "Профессиональное обучение. Компьютерные технологии" (декан — профессор Ярышев Николай Алексеевич).
1993
Реорганизация факультета точной механики и вычислительной техники и создание факультета компьютерных технологий и управления (декан — профессор Немолочнов Олег Фомич) и факультета точной механики и технологий (декан — профессор Комяк Николай Иванович).
1994
По итогам Государственной аттестации институту присвоен статус Университета. Переименование в Санкт-Петербургский государственный институт точной механики и оптики (технический университет) (приказ Государственного комитета Российской Федерации по высшему образованию от 26 мая 1994 года №524).
На фотографиях:
Церемония присвоения cтатуса Университета. Выступает действительный член Российской Академии наук, лауреат Ленинской премии, лауреат Государственной премии СССР, автор метода объемной голографии и принципов динамической голографии Почетный доктор университета, выпускник ЛИТМО 1954 года профессор Денисюк Юрий Николаевич; внизу: Почетные доктора Университета ИТМО Клебанов Илья Иосифович (фотография слева), Сергеев Дмитрий Васильевич, Петровский Гурий Тимофеевич и ректор Новиков Геннадий Иванович (фотография в центре), Петровский Гурий Тимофеевич и Клебанов Илья Иосифович (фотография справа).
C 1994
Ежегодное проведение Всероссийских научно-методических конференций "Телематика".
1994
В рамках федеральной целевой программы "Университеты России" в университете создан Санкт-Петербургский узел Федеральной университетской компьютерной сети России RUNNet (Russian UNiversity Network) (научный руководитель - профессор Васильев Владимир Николавеич). Начало построения сети RUNNet, которая объединила все крупные научно-образовательные центры России и является частью глобальной сети Интернет.
1995
Создание Учебно-научного центра "Оптика", объединяющего преподавателей, ученых и научных сотрудников университета, ГОИ имени С.И. Вавилова, Института высокомолекулярных соединений РАН, Института химии силикатов имени И.В. Гребенщикова РАН и Библиотеки Академии наук России с целью совершенствования учебного процесса и проведения совместных научных исследований в области оптических наук.
1995
Сборная команда университета по программированию, чемпион Санкт-Петербурга, заняла I место а Западно-Европейской зоне Всемирного студенческого чемпионата в Амстердаме, проводимой АСМ, а в 1996 год - IV место на чемпионате мира в Филадельфии (США) (руководитель команды — профессор Парфенов Владимир Глебович).
1996, Июнь
Проведение на базе университета двух Международных конференций: по нерезонансному взаимодействию света с веществом и по лазерной технике (председатель программных комитетов — профессор Вейко Вадим Павлович).
1996, Сентябрь
Осуществлен набор первых студентов для обучения по образовательным программам магистратуры.
1996, Декабрь
Избрание конференцией трудового коллектива университета на срок 5 лет ректором университета доктора технических наук, профессора Васильева Владимира Николаевича.
1996-2002
Регулярное участие университета в образовательных выставках в области учебной техники и образовательных технологий Минобразования России (Нижний Новгород, 1996, 2000; Челябинск, Санкт-Петербург, 1997; Новороссийск, 1999; Москва, 1999, 2000, 2001, 2002; Самара, 2000 и других).
1997
Создание Института комплексного военного образования (начальник — профессор Г.И. Кузнецов).
Открытие мемориальной доски в целях увековечения памяти известного русского поэта А.А. Шевелева, который учился в ЛИТМО в 1955-1961 годах. Мемориальная доска установлена на здании общежития университета.
Проведение в Санкт-Петербурге выставки "Современные образовательные технологии — EDUCOM '97" под эгидой Минобразования России.
Создание кафедры социометрии.
1998
Проведение Государственной аттестации вуза и подтверждение статуса университета Государственной аккредитацией вуза.
Реорганизация подготовки инженеров-оптиков, создание факультета оптико-информационных систем и технологий (декан — профессор С.М. Латыев).
В структуру университета вошел Санкт-Петербургский приборостроительный техникум (директор — В.А. Бахирев).
С 1998 года
Регулярное проведение Международных Балтийских студенческих олимпиад по автоматическому управлению.
1999
Создание Учебно-научного центра "Оптика и научное приборостроение" в рамках Федеральной целевой программы "Интеграция".
1999
Проведение Международной конференции молодых ученых и специалистов "Оптика-99" (сопредседатели Программного комитета — действительный член Российской Академии наук Г.Т. Петровский и профессор В.Н. Васильев).
Апрель 1999 года
Сборная команда университета заняла III место в чемпионате мира по программированию в Амстердаме.
Декабрь 1999 года
Опубликование распоряжения Правительства Российской Федерации от 2 декабря 1999 года № 2008-р о проведении в 2000 году мероприятий в ознаменование столетия Санкт-Петербургского государственного института точной механики и оптики (технического университета) как первого в России специализированного учебного заведения в области точной механики и оптики.